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mercoledì 1 aprile 2020

Il romanzo del Coronavirus SARS-CoV-2: la paura contro dati, mentre nel mondo 2,6 milioni di persone morivano ogni anno di infezioni respiratorie (esclusa la tubercolosi)

Punti salienti

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Confronto tra i tassi di incidenza e mortalità di quattro coronavirus comuni circolanti in Francia con quelli della SARS-COV-2 nei paesi OCSE.
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Al 2 marzo 2020, 90 307 pazienti erano risultati positivi alla SARS-CoV-2 in tutto il mondo, con 3086 decessi (tasso di mortalità del 3,4%).
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Al 2 marzo 2020, tra i paesi OCSE, 7476 pazienti erano risultati positivi per SARS-CoV-2, con 96 decessi (tasso di mortalità 1,3%)
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Al 2 marzo 2020, in Francia, 191 persone erano risultate positive alla SARS-CoV-2, con tre decessi (tasso di mortalità dell'1,6%).
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Nei paesi dell'OCSE. il tasso di mortalità per SARS-CoV-2 (1,3%) non è significativamente diverso da quello dei coronavirus comuni identificati nell'ospedale di studio in Francia (0,8%; P = 0,11).
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Il problema di SARS-CoV-2 è probabilmente sopravvalutato, poiché 2,6 milioni di persone muoiono ogni anno di infezioni respiratorie rispetto a meno di 4000 decessi per SARS-CoV-2 al momento della stesura.

ASTRATTO

SARS-CoV-2, il romanzo coronavirus dalla Cina, si sta diffondendo in tutto il mondo, provocando un'enorme reazione nonostante la sua bassa incidenza al di fuori della Cina e dell'Estremo Oriente. Quattro coronavirus comuni sono attualmente in circolazione e causano milioni di casi in tutto il mondo. Questo articolo confronta i tassi di incidenza e mortalità di questi quattro coronavirus comuni con quelli della SARS-COV-2 nei Paesi dell'Organizzazione per la cooperazione e lo sviluppo economico. Si è concluso che il problema della SARS-CoV-2 è probabilmente sopravvalutato, poiché 2,6 milioni di persone muoiono di infezioni respiratorie ogni anno rispetto a meno di 4000 decessi per SARS-CoV-2 al momento della stesura.

parole

COVID-19
Coronavirus
SARS-CoV-2







1 . introduzione

I coronaviridae rappresentano un'importantissima famiglia di virus animali e umani [ 1 , 2 ] in circolazione permanente. Quattro coronavirus umani comuni (HKU1, NL63, OC43 ed E229) causano il 10-20% delle infezioni respiratorie in tutto il mondo e sono presenti in tutti i continenti [3] , [4] , [5] , [6] , [7] , [8 ] , [9] , [10] , [11] , [12] , [13] , [14] ( Tabella 1). La mortalità è valutata male, ma è chiaro che ci sono portatori cronici e portatori asintomatici. Gli studi hanno dimostrato che ci sono tanti portatori asintomatici quanti pazienti sintomatici [ 3 , 9 ]. Sono stati segnalati tre episodi epidemici di coronavirus emergenti. Il primo, grave virus della sindrome respiratoria acuta (SARS), ha avuto un impatto molto limitato sulla morbilità e mortalità globali, con oltre 8000 casi riconosciuti e 774 decessi [ 15 , 16 ]. Il secondo coronavirus della sindrome respiratoria del Medio Oriente (MERS), è rimasto localizzato in Arabia Saudita, con una piccola epidemia di infezioni prevalentemente nosocomiali in Corea del Sud [17]. Il MERS-coronavirus, come la SARS, ha evidenziato il pericolo maggiore della trasmissione nosocomiale al personale sanitario, la cui salute è essenziale in queste epidemie [18] . Infine, SARS-CoV-2, il romanzo coronavirus apparso nel dicembre 2019, si è ampliato e ha interessato più di 90.000 persone in tutto il mondo [ 2 , 19 , 20 ]. Al momento della stesura di questo articolo, un numero significativo di casi si era verificato in Estremo Oriente. È incontestabilmente contagioso, poiché uno studio quasi sperimentale sulla nave da crociera Diamond Princess ha dimostrato che il confinamento di pazienti infetti con pazienti non infetti ha provocato una rapida infezione dei pazienti non infetti, portando a 700 ulteriori casi a bordo [21]. Tuttavia, i coronavirus nella circolazione comune rimangono predominanti a causa della loro distribuzione globale e della loro mortalità non trascurabile [ 14 , 22 ]. Lo scopo di questo studio era di condividere l'esperienza di un laboratorio di riferimento che rappresentava circa l'1% delle infezioni respiratorie gravi e diagnosticate, in particolare stagionali, in Francia. Ciò consentirà di valutare la mortalità relativa dei diversi coronavirus umani presentati negli ospedali di Marsiglia rispetto a quella della SARS-CoV-2.

Tabella 1 . Studi che hanno testato il coronavirus in pazienti con febbre in vari paesi

Primo autore [numero di riferimento]NazioneCasi testati ( n )Diagnosi di coronavirus
Trombetta [7]Brasile7757,6%
Zhang [10]Guangzou, Cina13 048244 (2,25%)
Zeng [11]Guangzou, Cina11 399489 (4,3%)
Killerby [14]Stati Uniti d'America18 8062,2%
Kiyuka [13]Kenia557310,1%
Owusu [9]Ghana593 casi13,7%
DubeSud Africa620 controlli10,5%
214 (tubercolosi)8%
Sipulwa [12]Kenia4178,4%
SubramoneySud Africa8604,8%
NunesSud Africa102615%
Le-Viet [3]Vietnam3784 (1,05%)

2 . Materiali e metodi

Assistenza Publique-Hôpitaux de Marseille (AP-HM) copre tutti gli ospedali pubblici di Marsiglia, inclusi quattro ospedali universitari: La Timone Hospital, Conception Hospital, North Hospital e South Hospital; ciò corrisponde a 3400 posti letto e 125 000 ingressi ogni anno [23] . Il laboratorio diagnostico di infezione IHU Méditerranée sottopone a test tutti i campioni di AP-HM in cui si sospetta la presenza di virus respiratori. La biologia molecolare viene utilizzata per la diagnosi. I risultati sono monitorati da un sistema di sorveglianza automatizzato settimanale nel laboratorio diagnostico, insieme a un sistema informativo di laboratorio (Nexlabs) [23] . I dati epidemiologici SARS-CoV-2 sono stati ottenuti attraverso una piattaforma online che raccoglie dati da agenzie pubbliche [24]. Le analisi statistiche sono state eseguite utilizzando il software BiostatGV.

3 . risultati

Nel 2016, ci sono stati 594000 decessi in Francia; Il 59,2% di questi decessi si è verificato in un istituto di cura [25] . Nello stesso anno, AP-HM ha riportato 2854 morti. Pertanto, si può stimare che circa lo 0,8% dei decessi negli istituti di cura in Francia è deceduto negli ospedali AP-HM. Questa stima fornisce un'approssimazione del numero di persone colpite da un agente patogeno in Francia in base al numero di persone che sono morte ogni anno negli ospedali AP-HM.
Dal 1 ° gennaio 2013 al 31 dicembre 2019, 21.662 campioni sono stati testati dal laboratorio diagnostico per l'infezione IHU Méditerranée. Tra questi, 770 campioni erano positivi per coronavirus, con otto decessi (tasso di mortalità dell'1%). Tra i coronavirus identificati, 63 sono stati identificati come HKU1 (un decesso, tasso di mortalità 1,6%), 74 identificati come NL63 (due decessi, tasso di mortalità 2,7%), 92 identificati come E229 (un decesso, tasso di mortalità 1,1%) e 160 sono stati identificati come OC43 (quattro morti, tasso di mortalità del 2,5%). Trecentottantuno coronavirus, diagnosticati prima del 2017, non sono stati assegnati a nessuno di questi quattro ceppi ( Tabella 2 ).

Tabella 2 . Risultati del laboratorio diagnostico Assistance Publique-Hôpitaux de Marseille (AP-HM)

AgentePosizioneCasi confermati ( n )Morti ( n )Tasso di mortalità (%)
Coronavirus aAP-HM, Marsiglia, Francia
Coronavirus OC4316040,0250
Coronavirus NL637420,0270
Coronavirus HKU16310,0159
Coronavirus E2299210,0109
Coronavirus bAP-HM, Marsiglia, Francia
Coronavirus OC437710,0130
Coronavirus NL6314600
Coronavirus HKU127710,0036
Coronavirus E2294300
un'
Dal 1 ° gennaio 2013 al 31 dicembre 2019.
B
Dal 1o gennaio 2020 al 2 marzo 2020.
Test sistematici (biologia molecolare) per SARS-CoV-2 sono stati eseguiti dal 1 ° gennaio 2020 al 2 marzo 2020. In totale, 7059 campioni di pazienti che presentavano sintomi infettivi sono stati testati dal laboratorio diagnostico dell'infezione IHU Méditerranée. Tra questi, 543 campioni erano positivi per i coronavirus, con due decessi (tasso di mortalità 0,36%): 277 campioni erano HKU1, 146 campioni erano NL63, 77 campioni erano OC43 e 43 campioni erano 229E. Nessun caso di SARS-CoV-2 è stato identificato tra questi campioni. Dei due decessi, un paziente aveva OC43 (tasso di mortalità 1,3%) e un paziente aveva HKU1 (tasso di mortalità 0,36%). Non ci furono morti per NL63 o E229 durante questo periodo.
Nello stesso periodo, IHU Méditerranée Infezione era il centro regionale per la rilevazione del nuovo coronavirus SARS-CoV-2. Al momento della stesura del presente documento, sono state eseguite 596 analisi su casi sospetti dall'emergere del nuovo patogeno, da cui sono stati identificati quattro casi di SARS-CoV-2. Inoltre, 709 cittadini francesi di ritorno dalla provincia di Hubei sono stati testati e tutti erano negativi per SARS-CoV-2.
Entro il 2 marzo 2020, un totale di 90 307 pazienti erano risultati positivi alla SARS-CoV-2 in tutto il mondo, con 3086 decessi (tasso di mortalità 3,4%). Tra i paesi dell'Organizzazione per la cooperazione e lo sviluppo economico (OCSE), 7476 pazienti sono risultati positivi alla SARS-CoV-2, con 96 decessi (tasso di mortalità 1,3%) ( Tabella 3 ). In Francia, 191 persone sono risultate positive alla SARS-CoV-2, con tre decessi (tasso di mortalità dell'1,6%).

Tabella 3 . Situazione epidemiologica internazionale SARS-CoV-2 (Organizzazione per la cooperazione economica e i paesi in via di sviluppo), 3 marzo 2020

paesiCasi confermati ( n )Morti ( n )Tasso di mortalità (%)
Germania15700.0
Australia3013.3
Austria1800.0
Belgio800.0
Canada2400.0
Corea del Sud4335280.6
Danimarca400.0
Spagna12300.0
Estonia100.0
Stati Uniti d'America10066.0
Finlandia700.0
Francia19131.6
Grecia700.0
Irlanda100.0
Islanda300.0
Israele1000.0
Italia2036522.6
Giappone27462.2
Lettonia100.0
Lituania100.0
Lussemburgo100.0
Messico500.0
Norvegia2500.0
Nuova Zelanda100.0
Olanda1800.0
Portogallo200.0
Svezia1500.0
Svizzera3800.0
UK4000.0
Totale7476961.3
Questo studio ha confrontato il tasso di mortalità della SARS-CoV-2 nei paesi OCSE (1,3%) con il tasso di mortalità dei coronavirus comuni identificati nei pazienti con AP-HM (0,8%) dal 1 ° gennaio 2013 al 2 marzo 2020. Il test Chi-quadrato era eseguito e il valore P era 0,11 (non significativo).

4 . Discussione

Questo studio ha scoperto che il tasso di mortalità delle comuni infezioni da coronavirus è dello 0,8% in Francia. In confronto, il tasso di mortalità di SARS-CoV-2 nei paesi sviluppati europei o americani di un livello economico comparabile è dell'1,3% ( Tabella 3). Se l'estrapolazione dei decessi negli ospedali AP-HM è corretta, nella Francia metropolitana, ciò rappresenterebbe 543 / 0,8 * 100 = 67 875 casi di pazienti ospedalizzati con un'infezione respiratoria con coronavirus comuni in 2 mesi, che è quasi il numero di casi di SARS-CoV-2 in tutto il mondo. In effetti, la mortalità per infezioni respiratorie dipende in larga misura dalla qualità delle cure e dall'accesso alle cure, e le forme gravi hanno una prognosi migliore nei paesi con infrastrutture mediche superiori. In queste condizioni, non sembra esserci una differenza significativa tra il tasso di mortalità di SARS-CoV-2 nei paesi OCSE e quello dei coronavirus comuni (χ 2 test, P= 0,11). Naturalmente, il principale difetto di questo studio è che la percentuale di decessi attribuibili al virus non è determinata, ma questo è il caso di tutti gli studi che riportano infezioni da virus respiratori, incluso SARS-CoV-2. In effetti, le infezioni virali sono infezioni dell'ecosistema in cui il risultato dipende dagli inoculi e dal microbiota circostante [26] . Pertanto, alcuni batteri sembrano essere associati a manifestazioni sintomatiche, come Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae e Staphylococcus aureus, che sono noti per causare un eccesso di mortalità a causa di infezione secondaria. Infine, la stagionalità, la posizione geografica, il calore e l'umidità sono co-fattori, così come l'età, il genere e le patologie sottostanti. In queste condizioni, e tutte le altre cose sono uguali, l'infezione da SARS-CoV-2 non può essere descritta come statisticamente più grave dell'infezione con altri coronavirus in circolazione comune.
Infine, nei paesi OCSE, la SARS-CoV-2 non sembra essere più letale di altri virus circolanti. Oltre ai coronavirus, ci sono 16 virus endemici in comune circolazione nei paesi sviluppati (adenovirus, bocavirus, citomegalovirus, enterovirus, virus A1 H1N1, virus A3 H3N2, virus dell'influenza B, metapneumovirus, virus parainfluenzae 1, virus parainfluenzae 2, parainfluenzae virus 3, virus della parainfluenza 4, parechovirus, picornavirus, rinovirus, virus respiratorio sinciziale) e 2,6 milioni di decessi per infezioni respiratorie (esclusa la tubercolosi) all'anno sono stati notati negli ultimi anni in tutto il mondo [27]. Ci sono poche possibilità che l'emergere di SARS-CoV-2 possa cambiare significativamente questa statistica. La paura potrebbe avere un impatto maggiore rispetto al virus stesso; un caso di suicidio motivato dalla paura della SARS-COV-2 è stato segnalato in India [28] .
Inoltre, i coronavirus raramente testati sistematicamente in tutto il mondo possono persistere nella faringe delle persone asintomatiche, che rappresentano una potenziale fonte di immunità della popolazione [29] . Inoltre, va notato che studi sistematici su altri coronavirus (ma non ancora per SARS-CoV-2) hanno scoperto che la percentuale di portatori asintomatici è uguale o addirittura superiore alla percentuale di pazienti sintomatici. Gli stessi dati per SARS-CoV-2 potrebbero presto essere disponibili, il che ridurrà ulteriormente il rischio relativo associato a questa patologia specifica.

Richieste dell'autore

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Tabella 1: i riferimenti di Dube, Subramoney e Nunes non sono nell'elenco dei riferimenti. Fornire riferimenti o eliminare citazioni







Dichiarazione di interesse concorrenziale

Nessuno dichiarato.

finanziamento

Questo lavoro è stato supportato dal governo francese nell'ambito del programma "Investimenti per il futuro" gestito dall'Agenzia nazionale per la ricerca, Méditerranée-Infezione 10-IAHU-03.

Approvazione etica

Non applicabile. Le prove sui rimpatriati sono state approvate dal comitato etico del Comitato per la protezione delle persone (CPP Ile de France VI, 6 febbraio 2020).







Riferimenti

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